Fue mandatario provincial desde 1987 hasta 1991. El último cargo público que ostento fue en el Parlamento del Mercosur.
Después de atravesar una enfermedad delicada y acompañado de su familia, el exgobernador de Salta, Hernán Cornejo, falleció a los 78 años.
Cornejo fue integrante del Partido Justicialista, fue gobernador de la provincia de Salta entre 1987 y 1991, y formó parte del gobierno de Roberto Romero ocupando el cargo de ministro de Economía y presidente del directorio del Banco de la Provincia de Salta.
En 1996 fue nombrado Secretario de Empleo y Capacitación Laboral del Ministerio de Trabajo de la Nación por el presidente Carlos Menem. Se mantuvo en el cargo hasta 1998. Posteriormente fue designado Embajador argentino en Ecuador manteniéndose hasta la presidencia de Eduardo Duhalde.
Retomó cargos en la provincia de Salta de la mano de Juan Manuel Urtubey donde fue designado representante de la ZICOSUR y fue elegido en 2015 diputado por el Parlasur con el 40,8 por ciento de los votos.